Litvisor — мониторинг литературы для фармаконадзора » О системе LITVISOR » Теги и правила автоматической обработки

Теги и правила автоматической обработки

Оглавление
  1. Как создать тег?
  2. Как создать правило?
  3. Как изменить / удалить тег?
  4. Синтаксис правил — как правильно построить запрос?
  5. Применение комбинации тегов
  6. Библиотека тегов и правил

 

Для того, чтобы облегчить работу с карточками упоминаний, в системе представлены функции автоматической обработки карточек, поступивших в систему.

Данная функция включает в себя создание тегов и правил, которые направлены на поиск и выделение определенных ключевых слов (слов-триггеров) в карточках упоминаний.

Важно: Ключевые слова, созданные при помощи тегов и правил, применяются после автоматического сбора информации системой и не влияют на исходный запрос данных на основании объектов мониторинга проекта. Применение тегов и правил не ведет к сужению поиска – информация не теряется.

Для того, чтобы задать определенное ключевое слово, необходимо сначала создать тег и затем создать к нему правило.

Как создать тег?

 

Для того, чтобы создать тег, необходимо:

  1. Перейти во вкладку Настройки. Затем перейдите во вкладку Настройки тегов.
  2. Нажмите на кнопку «Создать новый тег».
  3. После нажатия на кнопку Вам откроется строка для ввода Заголовка (название) и выбора цвета тега. Введите название тега и выберите цвет тега, нажав на серый кружочек.
  4. После того, как Вы ввели название тега и выбрали цвет, нажмите на двойную галочку для того, чтобы сохранить тег.
  5. Готово! Тег создан. Но он пока не активен. Для того, чтобы тег заработал, нужно создать правило.

Важно:

  • Если Вы начали создавать тег, но хотите отменить создание тега, нажмите на значок отмены (перечеркнутый кружок) — тогда тег не сохранится.
  • Каждый тег должен иметь уникальное название. При попытке создать тег с уже существующим названием система попросит Вас выбрать другое название.

Как создать правило?

 

Для того, чтобы система понимала, на какие карточки ей проставить тег, нужно создать правило.

Правило включает в себя поисковый запрос.

Чтобы создать правило:

  1. Перейти во вкладку Настройки. Затем перейдите во вкладку Настройки правил и нажмите на кнопку «Создать новое правило».
  2. В окне создания правила введите название правила. Название может быть любое (например, «Правило №1» или «Правило для тега «КИ») – оно будет отображено в списке правил.
  3. Затем выберите соответствующий тег в выпадающем списке «Выберите тег«.
  4. После этого введите в окно запроса сам запрос. О том, как правильно составить запрос, мы поговорим ниже в разделе «Синтаксис правил — как правильно построить запрос?». Вы также можете взять предлагаемый нами запрос (см. раздел «Библиотека правил и тегов»).
  5. После внесения запроса нажмите кнопку «Сохранить». Если Вы хотите отменить создание правила нажмите на кнопку «Закрыть».
  6. Готово! Правило создано. Теперь нажмите кнопку «Запустить обработку» напротив созданное правила, и система проставит теги на карточки.

Важно: После нажатия на кнопку «Запустить обработку» система проставит тег на уже имеющиеся карточки и будет автоматически проставлять тег при сборе новой информации.

Как изменить / удалить тег?

 

Созданные теги не редактируются.

Если Вы еще не применяли тег (кнопка «Запустить обработку») и он не проставлен на карточках, то Вам нужно нажать на значок «Карандаш» и нажать на «Корзину», чтобы удалить тег из списка. При удалении тега закрепленное за ним правило удаляется автоматически.

Если Вы применили тег, но хотите удалить его и очистить от него карточки, то следует:

  1. Сначала удалить правило, связанное с тегом.
  2. Удалить тег.

После этого карточки очистятся от тега.

Синтаксис правил — как правильно построить запрос?

 

Для того, чтобы система прикрепила тег на карточку, ей нужно правило с указанием на то, какие слова она должна искать.

Запросы могут быть простые (например, поиск одного слова) или сложные (поиск группы слов, словосочетаний и пр.).

В этом разделе мы разберем синтаксис правил – как их правильно создать, чтобы они корректно работали.

Поиск по одному слову

 

Допустим, Вы хотите отфильтровать (найти) карточки, которые содержат слово «побочный».

Для этого Вам нужно будет ввести в окно запроса:

«побочный».

Важно!

Система нормирует введенное слово, т.е. система ищет по основе слова.

Так, система также найдет слова «побочный», «побочная», «побочных», «побочка» и т.д.

Поиск карточек, которые содержат словосочетание

 

Для поиска по словосочетанию, например, «побочный эффект», используйте оператор <->.

Данный оператор используется в тех случаях, когда системе нужно искать слова рядом друг с другом (как в словосочетании).

Таким образом, для поиска словосочетания «побочный эффект» нужно записать:

побочный <-> эффект.

Поиск карточек, которые содержат словосочетание из 3 (трех) и более слов

 

Тот же оператор <-> используется при поиске словосочетания, состоящего из 3 (трех) и более слов.

Например, для поиска словосочетания «опыт применения препарата» нужно записать:

опыт <-> применения <-> препарата.

Поиск карточек, содержащих хотя бы одно из нескольких слов-синонимов

 

Для поиска хотя бы одного из искомых слов, например, одного из синонимов, используют оператор OR.

Например, Вам нужны карточки, которые содержать слова «побочный», «нежелательный» или «adverse».

Правило будет выглядеть следующим образом:

побочный OR нежелательный OR adverse.

Система поставит тег на карточки, которые содержат хотя бы одно из этих слов (а возможно и все указанные слова).

Поиск карточек, содержащих хотя бы одно из нескольких словосочетаний

 

Если Вы хотите найти хотя бы одно из нескольких словосочетаний, используйте оператор <-> и оператор OR.

Например, Вам нужно найти или «побочный эффект», или «нежелательная реакция».

Запись будет выглядеть так:

побочный <-> эффект OR нежелательная <-> реакция.

Система поставит тег на карточки, которые содержать «побочный эффект» или «нежелательная реакция» (или оба этих словосочетания).

Поиск карточек, содержащих хотя бы одно из нескольких слов или словосочетаний

 

Если у Вас в запросе есть и слова, и целые словосочетания, используйте тот же синтаксис:

Например, Вам нужно найти или «побочный эффект», или «нежелательная реакция», или «аллергия».

Запись будет выглядеть так:

побочный <-> эффект OR нежелательная <-> реакция OR аллергия.

Поиск карточек, которые обязательно содержат все указанные слова 

 

Если Вам нужно найти ключевые слова, но не обязательно рядом в тексте, воспользуйтесь оператором AND.

При использовании оператора AND система ищет все указанные слова в тексте, но они не обязательно рядом (как в словосочетании).

Например, Вам нужно найти запись, в тексте которой будет и «нежелательное явление», и «клиническое исследование».

Запись будет выглядеть так:

нежелательное <-> явление AND клиническое <-> исследование.

Карточки, которые не содержат определенные слова (исключение карточек)

 

Если Вам нужно исключить из выдачи карточки, которые содержат какое-то слово, воспользуйтесь оператором NOT.

Например: Вы хотите исключить карточки со словом «доклинический”.

Запрос: NOT клинический

Важно: тег проставится на карточки, в которых нет слова «доклинический».

Еще один пример:

Допустим, Вы хотите найти карточки, которые содержат «пациенты», но не содержат «дети».

Запрос: NOT дети AND пациенты

Сложный запрос с несколькими операторами

 

Вы можете использовать несколько операторов в запросе, но будьте внимательны – у операторов разный приоритет (ниже указаны операторы в порядке убывания приоритета):

1) NOT

2) <->

3) AND

4) OR

Если Вы хотите повысить приоритет операторы, используйте скобки ()

Важно: место оператора имеет значение!

Рассмотрим пример:

Запрос: Пациент AND побочка OR клинический

Система: карточки с «пациент» и «побочка» ИЛИ карточки с «клинический»

 

Запрос: Пациент OR побочка AND клинический

Система: карточки с «пациент» ИЛИ карточки с «побочка» и «клинический»

 

Запрос: (Пациент OR побочка) AND клинический

Система: карточки с «пациент» и «клинический» ИЛИ карточки с «побочка» и «клинический»

Ниже приведена сводная таблица с описанными примерами

Описание запроса Пример Запрос правила Система найдет:
Одно слово Побочный Побочный Карточки со словом «побочный» в различных падежах
Словосочетание (из двух слов) Побочный эффект Побочный <-> эффект Карточки со словосочетанием «побочный эффект»
Словосочетание (из трех и более слов) Опыт применения препарата Опыт <-> применения <-> препарата Карточки со словосочетанием «опыт применения препарата»
Хотя бы одно слово из нескольких слов «Побочный» или «нежелательный» Побочный OR нежелательный Карточки со словами побочный или (и) нежелательный
Хотя бы одно словосочетание из нескольких словосочетаний «Побочная реакция» или «нежелательный эффект» Побочная <-> реакция OR нежелательный <-> эффект Карточки со словосочетанием «побочная реакция» или (и) «нежелательный эффект»
Хотя бы одно слово/словосочетание из нескольких слов/словосочетаний «Побочная реакция» или «нежелательный эффект» или «аллергия» Побочная <-> реакция OR нежелательный <-> эффект OR аллергия Карточки со словосочетанием «побочная реакция» или (и) «нежелательный эффект» или (и) «аллергия»
Все слова (но не обязательно рядом) И «аллергия», и «клинический» Аллергия OR клинический Карточки со словами «аллергия» и «клинический»
Все словосочетания (но не обязательно рядом) И «нежелательное явление», и «клиническое исследование» Нежелательное <-> явление AND клиническое <-> исследование Карточки со словосочетаниями «нежелательное явление» и «клиническое исследование»
Исключение слова из выдачи Без слова «доклинический» NOT доклинический Карточки, не содержащие слово «доклинический»
Наличие одного слова при условии исключения другого слова «Пациенты», но не «дети» NOT дети AND пациенты Карточки со словом «пациенты», но не содержащие «дети»
Наличие нескольких слов при условии исключения других слов «Пациенты», «дети», «мужчины», «женщины», но без «животные», «мыши», «крысы» NOT (животные OR мыши OR крысы) AND (пациенты OR мужчины OR женщины) Карточки со словами «пациенты» или «дети» или «мужчины» или «женщины», но без «животные» или «мыши» или «крысы».
Слово через дефис Metformin-induced Metformin-induced Карточки со словами «Metformin-induced»
Словосочетание через дефис Acetylsalicylic acid-induced Acetylsalicylic <-> acid-induced Карточки со словами Acetylsalicylic acid-induced
Смешение операторов AND и OR Пример 1 Пациент AND побочка OR клинический Карточки с «пациент» и «побочка» или карточки с «клинический»
Пример 2 Пациент OR побочка AND клинический Карточки с «пациент» или карточки с «побочка» и «клинический»
Пример 3 (Пациент OR побочка) AND клинический Карточки с «пациент» и «клинический» или карточки с «побочка» и «клинический»

 

Применение комбинации тегов

 

Помимо создания сложных запросов, Вы также можете искать карточки по комбинации тегов — для этого Вам нужно выбрать нужные теги в фильтре «По тегу» и нажать на кнопку AND (подробнее в разделе «Применение фильтров»).

 

Библиотека тегов и правил

 

В рамках литературного мониторинга из научной медицинской литературы, как правило, отбирают:

  • исследования на пациентах, в которых содержатся описания НР и другие данные по безопасности (например, данные о резистентности);

  • мета-анализы и систематические обзоры, содержащие данные по безопасности;

  • клинические случаи;

  • анализ баз данных по фармаконадзору (FAERS, Vigibase и другие).

Нерелевантными статьями являются in vitro / in vivo / in silico исследования.

Мы понимаем, что создание правил – дело непростое, поэтому наши специалисты подготовили для Вас библиотеку готовых тегов и правил.

Для того, чтобы создать правило из библиотеки в своем проекте, скопируйте запрос и вставьте в окно запроса при создании правила.

Также если Вы хотите создать собственное правило, но испытываете с эти трудности, напишите Ваше предложение нам в техподдержку, и мы обязательно поможем Вам в его составлении.

Тег для выявления событий, вызванных препаратом

 

Для того, чтобы выявить любые события, вызванные препаратом, в англоязычной литературе следует искать словосочетания [МНН]-induced, -related, -associated. Соответственно, мы рекомендуем создать тег для каждого МНН с правилом для поиска данных словосочетаний.

Например, для МНН Ibuprofen:

Тег «Ibuprofen-related»

Запрос правила:

Ibuprofen-induced OR Ibuprofen-related OR Ibuprofen-associated

Запрос правила для многосоставных МНН (например, Acetylsalicylic acid):

Acetylsalicylic <-> acid-induced OR Acetylsalicylic <-> acid-related OR Acetylsalicylic acid-associated

Тег «Клинический случай»

 

Данный тег позволяет найти клинические случаи и серию клинических случаев.

Запрос правила:

case <-> report OR case <-> study OR case <-> series OR report <-> of <-> rare <-> case OR rare <-> case OR клинический <-> случай OR серия <-> случаев OR редкий <-> случай

Тег «Мета-анализ»

 

Данный тег позволяет найти статьи, описывающими мета-анализы или систематические обзоры.

Запрос правила:

Мета-анализ OR meta-analysis OR систематический <-> обзор OR systematic <-> review

Тег для выявления исследований по анализу баз данных по фармаконадзору (FAERS, VigiBase, EudraVigilance и пр.)

 

Данный тег позволяет найти статьи, в которых будут описаны исследования национальных баз данных по фармаконадзору.

Запрос правила:

FAERS OR pharmacovigilance OR FDA <-> Adverse <-> Event <-> Reporting <-> System OR WHO <-> Database OR Vigibase OR анализ <-> базы данных OR фармаконадзор OR European <-> database OR EudraVigilance OR JADER

Тег «Клинические исследования»

 

Данный тег предназначен для поиска слов, которые является ключевыми для описания клинических и наблюдательных исследований.

Запрос правила:

retrospective OR cohort OR cross-sectional OR case-control <-> study OR single-center OR observational OR multicenter OR phase <-> I OR phase <-> II OR phase <-> III OR phase <-> IV OR phase <-> 1 OR phase <-> 2 OR phase <-> 3 OR phase <-> 4 OR double-blind OR randomized OR controlled <-> trial OR longitudinal <-> analysis OR prospective OR retrospectively OR epidemiology <-> study OR crossover <-> study OR pilot <-> study OR comparative <-> study OR multicentre <-> study OR ретроспективный OR когортный OR одноцентровой OR мультицентровой OR наблюдательный OR обсервационный OR ослепленный OR плацебо-контролируемый OR рандомизированный OR двойное-слепое OR проспективный OR пилотный OR сравнительное <-> исследование

Тег «Детская популяция»

 

Данный тег предназначен для поиска упоминаний детской популяции в статьях.

Запрос правила:

child OR kid OR children OR boy OR girl OR adolescent OR teenager OR infant OR neonate OR newborn OR ребенок OR дети OR мальчик OR девочка OR подросток OR новорожденный OR грудной <-> ребенок

Тег «Беременность / Кормление»

 

Данный тег предназначен для поиска упоминаний беременных или кормящих женщин (пациентов).

Запрос правила:

pregnant OR pregnancy OR breastfeeding OR breastmilk OR breastfed OR mother OR беременная OR беременность OR лактация OR грудное <-> кормление OR грудное <-> вскармливание OR кормление <-> грудью OR грудное <-> молоко OR мать OR матерь

Тег для In vitro / In vivo исследований (доклинические исследования)

 

Данный тег можно применять для того, чтобы отфильтровать in vitro исследования и исследования на животных и переводить данные статьи в «Удаленные».

Запрос правила:

in <-> vitro OR in <-> vivo OR ex <-> vivo OR in <-> silico OR rat OR mouse OR mice OR bovine OR sheep OR dog OR camel OR horse OR canine OR danio <-> rerio OR transgenic OR wistar OR cell <-> line OR knockout OR ex <-> ovo OR egg OR hamster OR rabbit OR lamb OR 3D OR spheroid OR nanocarrier OR co-culture <-> model OR cellular <-> study OR nanoparticle OR microsphere OR nanofiber OR computational <-> study OR molecular <-> docking OR biomarker OR ecological OR nano OR крыса OR мышь OR бык OR овца OR собака OR верблюд OR лошадь OR животные OR рыба OR хомячок OR ягнята OR кролик OR клеточная <-> линия